La FCE cuenta con 2 carreras de Pregrado (Técnico en Administración y Gestión Pública, Tecnicatura Universitaria en Control y Auditoría Gubernamental), ambas con modalidad a distancia.

3 carreras de Grado (Contador Público Nacional, Licenciatura en Administración Licenciarura en Economía),

10 carreras de Posgrado con modalidad presencial (Doctorado en Administración Pública, Maestría en Administración de Empresas, Maestría en Administración y Finanzas, Maestría en Administración Pública, Maestría en Contabilidad y Auditoría, Maestría en Economía Aplicada, Especialización en Contabilidad y Auditoría para PyMEs, Especialización en Costos y Gestión Empresarial, Especialización en Sindicatura Concursal y Especialización en Tributación) y 3 carreras de Posgrado con modalidad a distancia (Especialización en Costos y Gestión Empresarial, Especialización en Dirección y Gestión de Organizaciones Públicas y Maestría en Responsabilidad Social Organizacional).

5 carreras de Posgrado compartidas con otras Unidades Académicas con modalidad presencial

Doctorado en Estudios Sociales (Carrera conjunta entre Facultad de Humanidades y Ciencias, Facultad de Ciencias Jurídicas y Sociales y Facultad de Ciencias Económicas de la Universidad Nacional del Litoral)

Maestría en Desarrollo y Políticas Públicas (Propuesta académica impulsada por la Facultad de Ciencias Jurídicas y Sociales, de Humanidades y Ciencias y de Ciencias Económicas de la Universidad Nacional del Litoral)

Maestría en Gestión Ambiental (Carrera compartida con todas las Facultades de la UNL, el Instituto de Desarrollo Tecnológico para la Industria Química (INTEC) y el Instituto Nacional de Limnología – INALI)

Maestría en Negocios Agroalimentarios (Carrera conjunta entre las Facultades de Ciencias Económicas y de Ciencias Agrarias de la Universidad Nacional del Litoral)

Especialización en Gestión y Vinculación Tecnológica (Carrera compartida con diez Unidades Académicas de la UNL, con sede administrativa en la Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas de la UNL)